Unité de prélèvements

Anatomie et Cytologie Pathologiques - Pr J.C Sabourin

• Histopathologie : diagnostic des lésions tissulaires sur biopsies et pièces opératoires.
• Cytopathologie : diagnostic des lésions cellulaires à partir de prélèvements cytologiques (liquides d'épanchement, ponctions d'organes, urines, LBA…).
• Tumorothèque : cryoconservation à visée sanitaire ou de recherche des fragments de tumeurs.
• Génétique somatique des tumeurs : recherche d'altérations génétiques de gènes impliqués dans la cancérogenèse, à visée thérapeutique et diagnostique.
• Cytogénétique de tumeurs : cultures cellulaires et caryotypes de certaines proliférations tumorales (sarcomes)

Bactériologie - Pr J.L Pons

• Détection - identifications de bactéries par amplification-séquençage de gènes domestiques.
• Recherches de gènes de virulence et de résistance.
• Typages moléculaires des souches bactériennes.

Biochimie - Pr A. Lavoinne

Biochimie spécialisée :

• Séparation des protéines et des peptides par FPLC ( Fast Protein Liquid Chromatography) pour la mise en   évidence de formes macromoléculaires de peptides et protéines dans les liquides biologiques.
• Séparation des protéines dans les liquides biologiques par électrophorèse et électrofocalisation.
• Exploration du renouvellement protéique dans les liquides biologiques et les tissus par CPG couplée à la spectrométrie de masse  avec utilisation d'isotopes stables.
• Dosage des marqueurs de la maladie d'Alzeihmer dans le LCR.
• Dosage des marqueurs de la fibrose hépatique.
• Dépistage de la trisomie 21 par dosage des marqueurs sériques maternels.

Dépistage et suivi des maladies héréditaires du métabolisme :

• Méthodes physiques :
  chromatographie liquide haute performance couplée à la spectrométrie de masse en tandem,
  chromatographie gazeuse couplée à la spectrométrie de masse,   électrophorèse…
• Etude de la fonction des protéines déficientes
• Etude moléculaire permettant d'identifier l'altération génétique causale.

L'activité de génétique moléculaire est réalisée dans le cadre du réseau national "plan maladies rares"

Cytogénétique et biologie de la reproduction - Pr B. Macé

• Diagnostic cytogénétique constitutionnel prénatal et postnatal d'anomalies chromosomiques :
  • Analyse du caryotype sur liquide amniotique, villosités choriales,  sang, peau, placenta  ....
  • Analyse de cytogénétique moléculaire : Hybridation in situ en fluorescence (FISH) à l'aide de sondes commerciales (Aneuvysion, syndromes microdélétionnels,  télomères ...) et à façon (BACs).
  • Cryoconservation de cultures cellulaires.
• Spermogramme.
• Evaluation de la chromatine du spermatozoïde (condensation, fragmentation et hybridation in situ chromosomique)
• Test de Hühner
• Inséminations intra-utérines avec sperme de conjoint ou de donneur
• Fécondation in vitro classique
• Fécondation in vitro avec micromanipulation des gamètes (ICSI) et sélection préalable des spermatozoïdes (IMSI)
• Eclosion embryonnaire assistée
• Congélation et conservation : embryons, ovocytes, spermatozoïdes, tissu ovarien et tissu testiculaire
• Don de spermatozoïdes
• Accueil d'embryon
• Recherche : Equipe d'accueil EA 4308 "Spermatogenèse et qualité du gamète mâle"

Hématologie - Dr B. Lenormand

• Analyse morphologique et immunophénotypique des populations cellulaires impliquées dans les hémopathies malignes, recherche de clones déficitaires en protéines GPI ancrées au cours de l'hémoglobinurie nocturne paroxystique, quantification des progéniteurs hématopoïétiques lors des prélèvements pour greffe de moelle.
• Détection des clones lymphocytaires au sein des infiltrats cellulaires cutanés et des proliférations lymphoïdes par  amplification génique et électrophorèse en gradient de dénaturation.
• Culture des progéniteurs hématopoïétiques dans le cadre des syndromes myéloprolifératifs.
• Etude des microparticules procoagulantes , des plaquettes en cytométrie de flux et marqueurs urinaire d'angiogénèse (bFGF et VEGF)
• Pathologies du globule rouge : enzymologie, maladies de membrane et étude de l'hémoglobine,  centre compétent pour le diagnostic et suivi des syndromes drépanocytaires majeurs
• Etude des polymorphismes génétiques, facteurs de risque candidats pour la maladie thromboembolique et l'insuffisance vasculo-placentaire par électrophorèse en gradient de dénaturation (DGGE) et par Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP).
• Le Centre Régional de Traitement des maladies Hémorragiques a été reconnu en 2008 par le Ministère de la Santé "Centre compétent pour la prise en charge des Maladies Hémorragiques Constitutionnelles rares ou sévères", notamment l'hémophilie et la maladie de Willebrand.

Immunologie - Pr F. Tron

• Identification des auto-anticorps et des lymphocytes autoréactifs : application au diagnostic des maladies auto- immunes.
• Propriétés fonctionnelles des lymphocytes T (T régulateurs, séquences TCR) : application au traitement des maladies auto-immunes et inflammatoires.
• Production d'agents biothérapeutiques cellulaires et géniques

Neurophysiologie - Pr J. Weber

• Traitement de la maladie de Parkinson par simulation cérébrale profonde : électrophysiologie per-opératoire pour le repérage des noyaux sous-thalamiques lors de l'implantation définitive des électrodes.

Parasitologie - Pr L. Favennec

• Etude in vivo de la sensibilité d'isolat de Giardia duodenalis aux nitro 5 imidazolés.
• Diagnostic de la maladie du poumon des oiseleurs avec préparation d'antigène de l'environnement proche du malade.
• Recherche de kystes de Giardia duodenalis et d'oocystes de Cryptosporidium parvum dans les eaux de surface, les eaux de captage et les eaux d'alimentation et détermination de leur viabilité et de leur infectivité.

Pharmacologie et Toxicologie - Pr C. Thuillez

• Identification et dosages de médicaments, toxiques et stupéfiants par HPLC/barrettes de diodes, CPG couplée à la spectrométrie de masse et HPLC couplée à la spectrométrie de masse en tandem.
• Etude des marqueurs du stress oxydant au moyen du couplage HPLC couplée à la spectrométrie de masse en tandem. Evaluation avant et après traitement et corrélation aux indices de la fonction endothéliale vasculaire.
• Mesure pharmacométrique des inhibiteurs de la cholinestérase utilisés dans la maladie d'Alzheimer ainsi que des médicaments antipsychotiques  : détermination dans le plasma par un radiorécepteur assay/binding.
• Dosage HPLC de l'activité catéchol O méthyl transférase érythrocytaire, élément prédictif de la réponse thérapeutique aux ICOMT adjuvants de la L-Dopa thérapie.
• Pharmacologie de l'endothélium (echotracking, pléthysmographie couplée à l'administration artérielle locale de réactifs pharmacologiques ou de médicaments)
• Propriétés mécaniques des artères de conductance et couplage cardiocirculatoire (echotracking vélocimétrie de l'onde de pouls, tonométrie d'aplanation vasculaire)
• Hémodynamique régionale et systémique (Doppler, laser-Doppler, bioimpédancemétrie)
• Pharmacovigilance
• Informations sur le médicament
• Iatrogénie médicamenteuse

Physiologie digestive, urinaire, respiratoire et sportive - Pr AM Leroi

• Suivi de cohorte de patients traités par neuromodulation des racines sacrées pour trouble de la continence anale et/ou urinaire.
• Exploration vidéomanométrique, permettant d'étudier de façon synchrone la manométrie pharyngo-oesophagienne et le transit pharyngo-oesophagien
• Nasofibroscopie fonctionnelle de la déglutition
• Exploration neurophysiologique du pharynx (potentiel évoqués moteurs, potentiels évoqués somesthésiques, stimulation magnétique corticale)
• Recherche d'une inflammation bronchique par le dosage du NO dans l'air expiré  (mesure importante dans la maladie asthmatique pour le dépistage et le suivi).
• Recherche d'intolérance à des substrats alimentaires par test respiratoires.

Virologie - Pr J.C.Plantier

• Séro-identification des Lentivirus par système ELISA peptidique.
• Quantification moléculaire des VIH du groupe O par PCR en temps réel.
• Typage moléculaire en temps réel de l'infection à VIH-2.
• Identification des résistances aux antirétroviraux de l'ensemble des types et des groupes de VIH à partir de prélèvements sur papier filtre.
• Phénotypage de sensibilités aux inhibiteurs non nucléosidiques et nucléosidiques du VIH.